A hirado.hu szerint a földhivatali bejegyzésből most az olvasható ki, hogy a Nemzeti Adó- és Vámhivatal zár alá vette a szcientológusok budapesti, Váci úti ingatlanát.
2017 októberében házkutatás volt a szervezet Váci úti székházában személyes adattal való visszaélés, valamint költségvetési csalás miatt indult nyomozások részeként. Jogellenes adatkezelés miatt maximális nagyságú, 20-20 millió forintos adatkezelési bírságot szabott ki a Magyarországi Szcientológia Egyházra és az egyház központi szervezetére a Nemzeti Adatvédelmi és Információszabadság Hatóság (NAIH).
A rendőrségi fellépésre azután került sor, hogy a NAIH-hoz több panasz is érkezett olyan magánszemélyektől, akik korábban a szervezet tagjai voltak, vagy egyéb más módon kapcsolatba kerültek a hivatalos egyházként el nem ismert szektariánus csoportosulással. A szcientológusok a vallásszabadság elleni támadásként értékelik a rendőrségi akciót.
A NAIH vizsgálata megállapította, hogy a szervezet nemcsak híveiről, hanem munkatársairól és harmadik személyekről is rengeteg adatot szerzett meg és birtokolt, ezek között olyanokat, amelyek felvétele jogszabálysértőnek számít (pl. politikai, szexuális irányultság, harmadik személyek adatai, pénzügyi tartozások).