Isiba rögtön október 1-jei hivatalba lépését követően kiírta az előre hozott választásokat, hogy megerősítse a botrányok miatt meggyengült Liberális Demokrata Párt (LDP) és Komeito párt alkotta kormánykoalíciót. Az október 27-i szavazáson azonban a koalíciónak nem sikerült megszereznie a 465 alsóházi képviselői hely több mint felét, s így elvesztette többségét.
A japán közszolgálati televízióban élőben közvetített hétfői szavazáson Isibának a második fordulóban sikerült megszerezni a legtöbb szavazatot, s ezzel legyőzte legnagyobb kihívóját, Josihiko Nodát, a Japán Alkotmányos Demokrata Párt vezetőjét.
Miközben Isibának az ország gazdasági nehézségeivel - köztük a pótköltségvetés benyújtásával, a jóléti kiadások növelésével és az áremelkedéssel - kell megküzdenie, továbbá nő a feszültség Kínával és Észak-Koreával, a kormányfőnek számos nemzetközi kötelezettségnek is eleget kell tennie. A jövő héten Brazíliába utazik a G20-csúcstalálkozóra, és az Egyesült Államokban a megválasztott elnökkel, Donald Trumppal is szeretne találkozni.