A 2006-os világbajnokságon a német válogatottal bronzérmes szakember a nyáron távozó Ottmar Hitzfeld helyét foglalja el a bajor klubnál.

A 43 éves Jürgen Klinsmann játékosként 1995 és 1997 között állt a Bayern alkalmazásában, ezalatt bajnokságot és UEFA Kupát nyert a müncheniekkel.

Ottmar Hitzfeld január 2-án jelentette be, hogy az idény végén távozik az együttestől, amely jelenleg vezeti a bajnokságot.