A bírót azzal gyanusítják, hogy a 2008-as vizsgálat során - amely az 1936-39 közötti polgárháború során Francisco Franco tábornok hívei által meggyilkolt több tízezer civil halálára és a Franco-diktatúra első éveire összpontosított - szándékosan túllépte hatáskörét. Ez volt az első hivatalos vizsgálat a spanyol történelem ezen fejezete ügyében, amely máig megosztja a lakosságot, és sok spanyol szemében továbbra is tabutémának számít.

A tényleges vádemelésről, Baltasar Garzón bíróság elé állításáról a legfelsőbb bíróság egyik vizsgálóbírája dönt majd.