Az építők egy 27 kútból álló megfigyelő rendszert állítottak fel, amely akár óránként is képet ad a karsztvizek állapotáról. Azt figyelik, hogy szökik-e a víz valahol.

Egy riasztási terv is készült, amely szerint elsőként az alagútépítőket értesítik, akik azonnal megvizsgálhatják, hogy az általuk alkalmazott technológia miként károsíthatta a környezetet.

Gulyás László elmondta: egy esetleges dunai árvíz nincs nagy hatással az építkezésre, egyedül a Fővám téri aluljáró építésének időzítésekor kell figyelemben venni az árvizes időszakokat.