Az inkák nemcsak háziállatként tartották, hanem vadászkutyaként is alkalmazták a fajt. Az inka birodalom bukását azonban a meztelenkutyák is megsínylették, a spanyol hódítók rengeteget megöltek közülük a bőrükért.

A faj ennek ellenére fennmaradt, de néhány évvel ezelőtt állatvédők arra figyelmeztettek, hogy a kipusztulás szélére sodródott.

A kormány ezért egy rendeletben meghagyta, hogy minden part menti műemléknél legalább egy pár perui meztelenkutyát kell tartani a turisták fogadására.

A lépés bevált, az utóbbi időben ismét nő a meztelenkutyák száma.