A német bíró 2004-ben is az élen végzett, akkor ő vezette a 2004-es portugáliai Európa-bajnokság döntőjét.
Előtte hat alkalommal az olasz Pierlugi Collina végzett a rangsor élén, 1994 és 1997 között pedig sorozatban négyszer Puhl Sándor lett a legjobb.
Markus Merk legemlékezetesebb tavalyi meccse a Bajnokok Ligája negyeddöntőjében volt, amikor szurkolói rendbontás miatt félbe kellett szakítania a Inter-Milan találkozót.
A magyar válogatott és valószínűleg az argentin Lionel Messi számára is vezetett egy emlékezetes mérkőzést.
Merk bíráskodott ugyanis a magyar-argentin barátságos mérkőzésen, amelyet a vendégek nyertek 2-1-re, és mintegy másfél perccel Messi becserélése után kiállította a játékost, aki a Puskás Ferenc Stadionban debütált a nemzeti csapatban.