Hodorkovszkijt azzal vádolták meg, hogy megsértette a börtön szabályzatát, amely megtiltja a foglyoknak, hogy élelmiszert vagy más személyes holmit adjanak el vagy ajándékozzanak egymás között.
Denisz Djatlov, Hodorkovszkij egyik ügyvéde szerint a börtön vezetősége újabb ürügyet talált arra, hogy magánzárkába zárja az adócsalás miatt ülő volt olajmágnást.
Oroszország hajdani leggazdagabb emberét szombaton zárták magánzárkába tíz napra, immár harmadszor. Januárban azért büntették, mert megtalálták nála az igazságügy-minisztérium két, az emberi jogokkal foglalkozó irányelvét, márciusban pedig mert nem az arra kijelölt helyiségben teázott.
Április 20-án a büntetés-végrehajtás közlése szerint saját biztonsága érdekében került magánzárkába, miután egy cellatársa megkéselte.