A gyógyító-megelőző, a gyógyászati segédeszköz és a pénzbeli ellátások időarányost meghaladó kiadásai mellett a járulék bevételek 82,9 milliárd forinttal maradtak el az időarányos előirányzattól.
Az egészségbiztosítási alap bevételei 2009 első kilenc hónapjában elérték a 978,24 milliárd, a kiadások pedig az 1.079 milliárd forintot. Az éves előirányzat 1.409,72 milliárd forint bevételi, 1.417,57 milliárd forint kiadási előirányzattal, és 8,85 milliárd forint hiánnyal számolt. A járulékbevételek 8,2 százalékkal maradtak el az előirányzottól, de a központi költségvetés hozzájárulása - 239,36 milliárd forint értékben - időarányosan teljesült.
A fekvőbeteg szakellátásra az előirányzatnál közel 10 milliárd forinttal többet, 253,7 milliárd forintot költöttek, míg a krónikus fekvőbeteg szakellátás közel 44 milliárd forintos kiadása több mint hárommilliárd forinttal haladta meg az előirányzatot. A járóbeteg szakellátás ráfordítása az első kilenc hónapban közel 85,33 milliárd forint volt, a túllépés több mint öt százalék, 5,37 milliárd forint.
A gyógyszertámogatás első háromnegyedévi előirányzata 257,28 milliárd forint volt, a tényleges felhasználás pedig 265,85 milliárd. A támogatás összegében szerepel a speciális beszerzés és a méltányossági gyógyszerkiadás is. Tisztán csak a gyógyszerek ártámogatására az előirányzottnál 20,75 milliárd forinttal többet, 245,78 milliárdot fordítottak. A gyártóknak és forgalmazóknak a támogatott gyógyszerek forgalmának arányában van befizetési kötelezettségük, mert a kassza felülről zárt: az idén nem lépheti túl a 343,04 milliárd forintot.