Jelentősen korlátozza az államháztartás hatékony működését a kincstári intézményekre vonatkozó eltérő előírások és az indokolatlan kivételek nagy száma. Ezt állapította meg az Állami Számvevőszék kétéves vizsgálata.
A szakértők szerint az egyes folyamatokat támogató kincstári informatikai rendszereknél, illetve azok fejlesztésénél is hiányoztak a központilag meghatározott stratégiák. Az ÁSZ úgy látta: az információs rendszer adatainak teljes körű megbízhatóságát rontja, hogy az adatszolgáltatási kötelezettségek elmaradása, időbeli pontatlansága nem jár következménnyel.