A brüsszeli tanácskozáson a magyar felet képviselő Göncz Kinga külügyminiszter erőteljes diplomáciai sikernek nevezte, hogy "bőven a szükséges minősített többség" fölött sikerült támogatókat találni a magyar moratórium fenntartásához. Elmondása szerint a döntés a környezeti szempontok és a lakossági vélemények miatt is nagyon fontos.
A Környezetvédelmi és Vízügyi Minisztérium (KvVM) a kormány hatásos diplomáciai és lobbi tevékenységének, valamint a civil szféra aktív részvételének tulajdonította a Magyarország számára kedvező döntést. A zöldtárca közleményében hangsúlyozta, hogy a génmódosított termékektől való mentesség Magyarország számára "kiemelt jelentőségű nemzeti ügy".
A tanács határozatát üdvözölte többek között Sólyom László köztársasági elnök és a Magyar Agrárkamara is. A mezőgazdasági szervezet szerint "jó döntés" született, hiszen a miniszterek ellenkező tartalmú döntése esetén számos munkahely szűnhetett volna meg Magyarországon.